锅炉脱硫设备在正常负荷使用中，根据使用情况不同会发生改化，或出现故障，这都是可以影响到设备的工作效率。
1、 锅炉脱硫设备内的气体流动太快，导致气流不稳定，粉尘被直接吹走，速度过快时还会将水膜抽走。其完全能够与水面接触的时间非常的短，还有一部分气体完全不能够与水面接触。由于除尘器内烟气与水接触的时间严重不足，这直接导致了二氧化硫未与水充分反应就随烟气进入空气。
2、、溶液循环量小，喷淋密度降低，一般要求喷淋密度在35-50立方米/㎡h，喷淋密度小，易使塔内填料形成干区，气液接触不好，脱硫效率下降，时间一长，就会形成局部堵塞，气液偏流，塔阻上升，造成塔堵。
3、用水如果不合理的话，特别是在硫除尘一体化装置中，干湿交汇区会积尘; 锅炉脱硫设备内部循环水中难溶盐类浓度的增加，加上本身构造问题，形成积尘现象;
4、催化剂选用不当，劣质催化剂价格虽较低，但在应用过程中，在塔内析出的单质硫不能及时随溶液带出去，时间久了，形成堵塔，严重时影响生产。
5、锅炉脱硫设备防腐玻璃鳞片脱落堵塞部分一级循环喷嘴、二级循环喷嘴，造成喷淋空隙区，导致烟气与循环液在脱硫塔吸收段无法充分接触，吸收反应不能有效进行，生成的亚硫酸盐在中和反应作用下生成的亚硫酸氢铵/硫酸氢盐，破坏了塔内硫酸铵结晶成长环境，致使硫酸铵结晶颗粒小，浆液分离效果差。
6、锅炉脱硫设备存在问题，一是脱硫塔填料选择不当，脱硫塔气液分布器、再分布器及除沫器结构不合理或安装出现偏差。脱硫塔在检修时，仅将塔内填料扒出清洗，而未将堵塞在除沫器和驼峰板的两驼降之间的碎填料和积硫及时清理出去，造成除沫器和驼峰板的降液孔不畅通，以致开车后，形成气体偏流，塔阻上升。二是溶液再生有问题，硫浮选效果差，悬浮硫上升，脱硫效率下降。
