锅炉除尘器在停止运行时，须采取保养措施，以防布袋受潮、板结和腐蚀，同时关闭除尘设备所有进口阀门，在停机期间按规定时间间隔打开进出口阀门，利用烟囱自然通风，或者打开电加热器加热，以驱除除尘器内的潮气。
锅炉除尘器如果停机时间短，不应为滤袋清灰，应注意除尘器的保温，如果停机时间长，则应为所有滤袋清灰，并利用引风机把除尘器内的残留酸性气体清除干净。锅炉除尘器长时间停止运行时，必须注意的是滤袋室内的湿气和风机轴承。滤袋室内的湿气凝结是含湿气体特别是燃烧产生的气体冷却所引起的，因此要在系统冷却之前，把含湿气体排除换置干燥的空气，防止滤袋和除尘本体的损坏和腐蚀。如果长时间停车时，还应当取下布袋，放入仓库进行保管。要充分注意风机的清扫、防锈等工作，特别要防止粉尘和雨水等进入电动机转子和风机、电动机的轴承部分，也要注意电动机的防潮，风机每3个月应启动运转一次。管道和灰斗堆积的粉尘要清扫，清灰机构与驱动部分要添加油。要设专人操作和检修转动部位定期注油.压缩空气系统的空气过滤器要定时排污，气包排水阀要定期排水。有贮气罐的也要定时排水。控制阀要由专业人员检修，定期对电磁阀和脉冲阀进行检查。
锅炉除尘器在停车间隙就可彻底清除滤袋的过多剩余附灰，方式是：利用停产间隙，除尘器轮流按室进行大风量脉冲清灰，出口的清灰阀门关闭，同时打开该室净端门，让反风从净端进来，从尘端出去。各室轮流进行反吹滤袋，可以去掉深入滤袋内部的积灰，使运行的剩余阻力降低。然后扫除积灰，紧闭各室的进出口阀门，打开旁路管道，除尘器就可以长期停用了。
